本篇文章給大家分享的是有關(guān)染色質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)4DGenome是怎樣的，小編覺(jué)得挺實(shí)用的，因此分享給大家學(xué)習(xí)，希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲，話不多說(shuō)，跟著小編一起來(lái)看看吧。

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4DGenome是一個(gè)染色質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)，采用了文獻(xiàn)檢索和軟件預(yù)測(cè)兩種手段來(lái)得到染色質(zhì)相互作用，收錄了來(lái)自5個(gè)不同物種共7百多萬(wàn)條互作記錄，網(wǎng)址如下

https://4dgenome.research.chop.edu/

涵蓋的5個(gè)物種列表如下

1. Homo sapiens(hg19)

2. Mus musculus(mm9)

3. Drosophila melanogaster(dm3)

4. Plasmodium falciparum(3D7)

5. Saccharomyces cerevisiae(sacCer3)

該數(shù)據(jù)庫(kù)中收錄的染色質(zhì)互作信息來(lái)源于以下多種技術(shù)手段

1. 3C

2. 4C

3. 5C

4. Capture-C

5. ChIA-PET

6. Hi-C

7. IM-PET

不同物種和不同技術(shù)手段對(duì)應(yīng)的數(shù)量顯示如下

輸入基因組區(qū)域或者基因名稱，都可以檢索相關(guān)信息，檢索框示意如下

檢索結(jié)果如下所示

點(diǎn)擊Details可以查看詳細(xì)的互作信息，InteractorA和InteractorB給出了互作的兩個(gè)染色質(zhì)區(qū)域的位置信息，Agene和Bgene表示與互作區(qū)域存在overlap的基因名稱, Contact Frequency表示互作頻率，LInk鏈接的是pubmed數(shù)據(jù)庫(kù)，可以查看對(duì)應(yīng)的具體文獻(xiàn)。

通過(guò)該數(shù)據(jù)庫(kù)，可以檢索多個(gè)物種的染色質(zhì)互作信息。

以上就是染色質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)4DGenome是怎樣的，小編相信有部分知識(shí)點(diǎn)可能是我們?nèi)粘９ぷ鲿?huì)見到或用到的。希望你能通過(guò)這篇文章學(xué)到更多知識(shí)。更多詳情敬請(qǐng)關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道。

文章題目：染色質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)4DGenome是怎樣的
標(biāo)題路徑：http://sd-ha.com/article12/geeedc.html

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