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LeafcircBase收錄了以下5種植物模式生物的環(huán)狀RNA信息

1. Arabidopsis thaliana

2. Glycine max

3. Oryza sativa

4. Triticum aestivum

5. Zea mays

采用以下兩款軟件來預(yù)測環(huán)狀RNA

1. find_circ

2. circRNA_finder

通過官網(wǎng)的Browse菜單，可以瀏覽不同物種對應(yīng)的環(huán)狀RNA數(shù)據(jù)

以擬南芥為例，結(jié)果示意如下

點(diǎn)擊來源基因的名稱，可以跳轉(zhuǎn)到對應(yīng)的數(shù)據(jù)庫。點(diǎn)擊右上角的Download按鈕，可以下載所有結(jié)果，點(diǎn)擊Datails可以查看環(huán)狀RNA的詳細(xì)信息，示意如下

可以看到對應(yīng)的軟件。如果在其他物種中存在同源，還會列出同源環(huán)狀RNA的信息，示意如下

通過該數(shù)據(jù)庫，不僅可以查看植物中環(huán)狀RNA的信息，還可以查看在不同物種間的同源性。

該數(shù)據(jù)庫中的結(jié)果是可以下載的，在下載的excel文件中，還可以看到每個(gè)環(huán)狀RNA對應(yīng)的樣本在SRA數(shù)據(jù)庫中的編號。

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